Instalasi Rawat Inap memberikan pelayanan rawat inap bagi pasien yang sedang menderita sakit dan diharuskan untuk menjalani rawat inap di RSUD Wates. disesuaikan dengan kebutuhan dari pasien, yang meliputi ruang kelas III, II, I dan VIP. Dalam beberapa kasus pasien diharuskan menjalani perawatan rawat inap di ruang isolasi untuk mencegah terjadinya penularan ke pasien lain atau untuk melindungi pasien itu sendiri